疫病是危害人民健康的最大因素，据《中国救荒史》不完全统计，中国古代疫病有明确文献记载的发生次数为周朝1次、秦汉时期13次，三国两晋南北朝时期34次，隋唐五代十国时期17次，两宋金元时期52次，明朝64次，清朝74次。古代民众在同各种疫病作斗争数千年时间里，通过不断的探索和实践，积累了丰富的防疫措施和经验。不仅有效地预防疫病流行，还促进传统医学对疫病的认识和治疗。
1.隔离法
（1）秦朝设“疠迁所”
年湖北省云梦县睡虎地发掘的秦代竹简上记载：“城旦，鬼薪疠，何论？当迁疠迁所。”在秦朝，人们如果发现身边有人染上麻风病时，要立即向官府报告，确诊为麻风病后，要将其送到疠迁所进行隔离，以防止麻风病传播蔓延。而疠迁所也是世界上医院。
（2）汉朝设“庵庐”
《后汉书·皇甫规传》载：“军中大疫，死者十三四。规亲入庵庐，巡视将士，三军咸悦。”此段文字证明在东汉的军队中设立“庵庐”以收治患有疫病的士兵，此举在隔离病人的同时，有效地防止了疫病蔓延，给寻找治疗疫病方法提供了良好的条件，同时提高士气，增强军队战斗力。
（3）唐朝设“疠人坊”
唐朝时期，我国佛教鼎盛，许多寺院的僧侣颇懂医理，在防治传染病时起到重要作用。很多寺院都设置了病坊用来“收养疠疾”，并且“男女别坊，四时供承，务令周给”。此类病坊将男女患者分开隔离，并提供治疗，医院的特点。后来病坊由朝廷监管，每当大疫发生时，朝廷就在“养病坊”收治疫病患者。
（4）清朝设“避痘所”
清初时期，天花流行，许多民众因感染天花而死。清政府为防止天花蔓延采取了许多措施，其中“避痘法”是最主要的方式。清朝的“避痘所”具有两层含义：一是指皇室专门设置的“避痘”场所，以防未患痘疹的皇室成员感染。其中顺治有“南苑”、“养心殿”两处避痘场所。康熙修建“承德避暑山庄”以避痘。二是指清政府制定相关避痘防痘的政令，将患有痘疹的人们迁移到固定的场所。
2.卫生驱疫法
（1）打扫卫生
西周时期，朝廷专设管理清洁卫生的职官，负责宫廷内外的除草、除虫以及清洁水源的工作，大多采用牡菊、嘉草、莽草、灰酒等方法，驱之、烧之、攻之、熏之、酒毒之、杀灭之。清雍正时期，曾颁布“沿道安设水缸，蓄水洒道”的政令，防街道尘土飞扬，污染环境。
（2）保护水源
《周易》有“井泥不食”的相关记载，强调要经常清除井内的泥沙，使井水保持清洁。春秋战国时期，人们对饮用水的卫生更加重视，《管子》载：“当春三月……抒井易水，所以去兹毒也。”而在河南登封战国阳城遗址内，还发现陶水管道、贮水池等城市水道设施。到了宋代，官府会定期沿街道巷陌“差顾淘渠人沿门通渠”，有效疏通污水管道，净化水源。到了清代，京城有二月淘沟的传统，并且认识到疫病会通过污水道传播。
（3）进口检疫
随着西方卫生知识的传入和通商口岸的开放，晚清政府逐渐引入了检疫、隔离等防疫手段。年东南亚地区霍乱盛行，上海、厦门两地口岸率先制定了港口检疫制度，凡从疫区来的船舶，须停靠在指定地点，待检疫完毕，方可上下人员和装卸货物。如发现船舶感染疫病，除了患疫者和船员需要被隔离以外，清政府还要对船舶进行短期隔离、除鼠、除虫及消毒等措施。
3.接种“疫苗“
（1）狂犬疫苗
狂犬病在古代称作瘈咬病，是一种病死率极高的病症，早在春秋时期，人们对狂犬病就有了初步的认识。到了西汉时期，人们已经认识到狂犬病的危害性以及驱逐疯狗的必要性，远离疯狗，是预防感染狂犬病的主要方法。到了唐代，孙思邈提醒民众携带竹棒逐疯狗。晋代葛洪所著《肘后备急方》对狂犬病有进一步的认识，其中记述被疯狗咬后二十天没有发病，才算是避过一劫，过百日后仍然没发病才说明病愈。除此之外，葛洪还记载了一种特别的方法，就是在处理完伤口之后，将疯狗捕获并打死，敲开其脑壳，取出其脑髓，敷在被咬者的伤口上，可以让狂犬病不再发作。这种预防狂犬病发作的治疗方法也是“狂犬疫苗“早期萌芽。
（2）天花疫苗
天花最早出现于葛洪的《肘后备急方》中，以后历代医家们根据临床观察，不断深入研究天花的病因、症状及治疗等方法，但治疗天花最有效的方法是人痘接种术。相传人痘接种术最早起源于我国明朝，清代张琰在《种痘新书》记录该术祖承聂久吾先生的种痘术，为人种痘多达万人，而聂久吾是明代著名的医学家。后来人痘接种术从“痘衣法”逐步改良成“痘痂法”，从养苗到种苗，逐步达到减毒治疗和预防天花的作用，开创人工免疫的先河。
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